In un attimo tutti gli esseri umani si sono trasformati in pietra e anche lo studente delle superiori Taiju è rimasto vittima di questo misterioso fenomeno. Tuttavia, molte migliaia di anni dopo… Taiju e il suo amico Senku si risvegliano e decidono di ricostruire la civiltà da zero! Si apre il sipario su un sensazionale racconto di adventure survival science fiction!
Senku, Taiju e Yuzuriha procedono con la creazione della polvere da sparo, ma proprio in quel momento vedono alzarsi in cielo una colonna di fumo. Senku è sicuro della presenza di altri esseri umani e, consapevole del rischio, risponde a sua volta al segnale. Nel frattempo si avvicina Tsukasa, che lo sta inseguendo per impedirgli di fabbricare l’esplosivo, e la situazione precipita…